战舰系统是游戏的核心玩法之一，玩家可以通过不同类型的战舰组建多样化的舰队。战舰主要分为战斗向和资源采集向两大类，战斗向舰船包括护卫舰、驱逐舰、巡洋舰、战列巡洋舰和航空母舰等，每种舰船都有独特的定位和功能。护卫舰作为基础作战单位，防御性能较强但火力一般，适合承担前排防御任务；驱逐舰则拥有更高的火力和吨位，是前期过渡阶段的主力；巡洋舰作为综合性大型战舰，攻防能力均衡，通常需要中期解锁；战列巡洋舰和航空母舰则是后期主力，具备强大的火力和特殊功能，但建造成本和时间较高。

战斗向战舰还可细分为多种功能类型，如前排能打能扛型、前排肉盾型、前排输出型、中排高攻型、后排高攻型等。例如奇美拉级巡洋舰属于攻防兼备的重型巡洋舰，拥有巡洋舰中最高的血量和护甲；艾奥级巡洋舰则是前排输出型，搭载离子炮系统能对大型舰船造成持续伤害；卡利斯托级属于后排高攻型，依靠重型鱼雷系统对目标造成毁灭性打击。不同功能类型的战舰需要根据战场需求合理搭配，才能发挥最大战斗力。

资源采集向舰船主要包括大、中、小型工程船，这类舰船独立于战斗舰船的人口计算系统，主要负责采集各种资源。工程船的选择原则是有大选大，因为大型工程船的采集效率更高。玩家需要尽可能多地建造工程船并派遣它们采矿，以保证资源供应充足。过了新手保护期后，工程船可能会遭到其他玩家攻击，因此需要适当安排防御力量保护矿区。

战舰的性能不仅取决于基础型号，还受到子型号和改装系统的显著影响。同一名称的战舰可能存在多个子型号，如奇美拉级就有基础型和重炮型之分，它们的站位和功能可能完全不同。每艘战舰的武器系统都可以进行个性化改造，蓝图通常包含5-7个配件系统等待改装，玩家可以根据需求强化特定属性，比如前排战舰优先提升护甲和闪避，输出型战舰则侧重伤害和暴击属性。

游戏中的舰船还涉及特殊的载机系统，部分巡洋舰和航空母舰可以搭载战斗机或护航艇。猎兵级重型舰载机巡洋舰虽然自身火力不足，但仅需18指挥值就能搭载4艘护航艇，战术灵活性极强；太阳鲸和CV3000是较为优秀的航空母舰，能够搭载各类战机执行多样化任务。这类载机舰船需要配合合适的舰载机才能发挥最大效用，因此玩家需要综合考虑舰船与舰载机的搭配策略。